- качественный управленческий учет построить штатными средствами имеющихся скриптов нельзя (если не считать Битрикса, у которого это эти функции исполняет 1С-бухгалтерия и 1С-предприятие)
...
Дело в том, реализовывать управленческий учет на любом интернет магазине (включая Битрикс) совершенно бесполезная затея.
Это совершенно разные сущности.
Не хочу растекаться мыслью по древу, но интернет магазин (любой) оперирует только со счетами, а управленческий учет с движением денег, движением товаров (это НУ ОЧЕНЬ кратко ;-)).
Можно только говорить о корректном обмене между интернет -магазином и учетной системой.
А это уже меняет дело.
У битрикса хороший механизм обмена с 1С. У Престы плохой, но возможно в будущем станет нормальным.
Вот и все.