1. Можно с помощью прайс листа эксель загружать сразу весь товар, или надо каждый товар отдельно вносить?!
Можно использовать импорт excel->csv и загрузить все товары разом, или заносить товар по одному используя Каталог>Добавить товар
2. Пытался сменить шаблон, так графика вся ушла, только текст и то всё ушло в левую сторону, как поправить данный глюк, я где-то читал о данной проблеме на форуме но не нашёл повторно?
Смотрите в HTML куда что идет/подключается, поправьте header.tpl, если сами не разобрались наймите специалиста.