Когда клиент делает заказ через интернет магазин, он приходит в админку, к заказу присватывается статус "в обработке", который обычно стоит по умолчанию. Но иногда заказы пропадают, какой именно клиент, какой по счету, через какую платежную систему был сделан заказ, абсолютно не важно, каждый раз по разному. В бд этот заказ присутствует. Если вбить его ссылку на прямую, получается открыть этот заказ. В сломанном заказе отсутствует статус, чего быть не должно, если этот статус проставить в ручную, заказ выравнивается и попадает к остальным.

Сам баг появляется раз в месяц от силы. Даже не знаю куда копать

скорее всего бага со стороны хостера. у меня тоже порой бывает такое, но проявляется со статусом Заказ принят.

У меня такое было в Prestashop 1.5 раза 4-5
Исправилось как-то само. Возможно действительно были какие-то перебои с хостингом... Так и не нашел причины