Проблема в следующем, в модуле jbx_menu прописывается меню "Гланая", "Категории", "Товары" и т.д. Как сделать под этими названиями ещё текст более мелким шрифтом.

Попробуйте добавить пункт


И для класса small пропишите нужный font-size шрифта в CSS.

Это сработает если модуль пропустит в качестве пункта меню html-код.

Не модуль не понимает.

А в каком файле вооще храниться надпись ГЛАВНАЯ? Может там попробывать???

Она хранится не в файле а в базе данных. Сделать две разных надписи в одном пункте не получится, без переделки модуля, потому что вторую надпись тоже нужно где-то хранить.

Еще один вопрос по этому модулю. Сделать его прозрачным получилось но при наведении на него мышкой появляеться подсветка белый прямоугольник в котором идет название раздела. Вопрос: как убрать этот прямоугольник точнее зделать его прозрачным тоже??? Или хоть скажите где ковырять???

Ищите в css файле класс с модификатором hover. Если класс, например, назывался .test то вам нужно найти .test:hover {...}
Уберите оттуда background: #fff

Точное название для класса не подскажу - нет под рукой установленного модуля.