Ковыряю шаблон под себя. Дабы не портить всё, делаю это в отдельном шаблоне. Однако когда переношу в темы (themes) модули пропадает русификация этих (перенесённых) модулей. Как это побороть бы?

В тема/modules нужно переносить не сами модули, а их шаблоны. В ту же папку нужно положить файл русификации ru.php. В файле заменить название старой темы (prestashop) на название новой.

После долгого размышления над ответом понял следующее - переносить можно и весь модуль, но нет смысла, достаточно перенести tpl, и главное в ru.php заменить слово (слова) prestashop на название темы.
Просто в той форме, какой был дан ответ, он не показался мне понятным.