На новом домене открывается главная страница по новому адресу. При попытке зайти в админку, страница переадресовывается по старому адресу (старому домену). Как сделать чтобы вся навигация по сайту была привязана к новому домену? Заранее спасибо!!!

1. config\settings.inc.php в конце обязательно поставьте слеш и не надо писать http://

2. В базе данных ps_configuration есть два поля где может быть прописан старый домен PS_SHOP_DOMAIN и PS_SHOP_DOMAIN_SSL посмотрите и замените на новый.

Первый пункт неверен. Там нужно директорию относительно корня сайта писать.
Домен меняется в админке через Настройки/SEO

Может быть этот вопрос не в том посте. А как поменять домен в версии 1.3.1 ?

В 1.3 ничего менять не нужно. Только кэш очистить

Кэш очистил, но при попытке входа в админку все равно перебрасывает на старый домен.