Есть в магазине часть товаров на складе с доставкой 1-2 дня.
И часть товара на заказ с доставкой 3-4 недели.
Как лучше сделать товар на заказ в ИМ?

У меня пока вариант такой:
- пишу кол-во товара 100(наобум)
- текст когда товар заканчивается: на заказ
- текст когда разрешено заказать через контакт: на заказ
- если товар закончился - разрешить заказ
Ну и в итоге просто заказывается как обычный товар.

И ещё, когда товар заканчивается над кнопкой "добавить в корзину" появляется надпись(ссылка) "Notify me when available", причем ссылка не работает. Как или убрать надпись или сделать русской?

Если у вас бесконечный товар (если товар закончился - разрешить заказ ) нехер заполнять тексты, он же бесконечен.

Для вас есть раздел песочница!

Ну во-первых при таком раскладе идут ненужные письма клиенту что товар закончился, что может ввести его в заблуждение.
Во-вторых это невтемная надпись на английском "Notify me when available".

Заходим в Переводы > Модулей, и там уже ищем "Notify me when available"

У меня стоит возможность заказывать товары с нулевым остатком, однако все равно клиенту приходят письма что товар закончился. Где это убрать?

Панель Управления >> Модули :: Почтовые предупреждения