Когда товар без комбинаций - все нормально. Ввожу комбинации товара (через группы и атрибуты) - цена пересчитывается. Не 10 рублей, а 447 рублей. Т.е. воспринимается как 10 евро что ли.

Устновите v0.5 с нуля. в 0.4 был баг.

А база с товарами? Придется снова все делать?

Может прокатит. Удали все валюты, кроме доллара (доллар сделай главным), потом создай Евро и Рубль, и сделай обновление стоимости валют.
Должно сработать.

Это делать в том случае, если оставлять старую версию магазина?

А где работать с валютами?

И вообще что посоветуете?

Стоит все же удалить старую версию и установить V0.5?

Нет конечно же, можно и без удаления все поправить, способ описан выше, если стояла старая сборка, ставьте сверху 0.5 и проделайте все что написал выше.

Возможно заработает и без удаления валют, оставьте тогда рубль по умолчанию выставьте на Рубль 1.0000, и обновите валюты, не заработает тогда ставьте 0.5.

Сделал. База осталась.
Только нужно сделать:
4. Очищаем темп смарти от старой версии /smarty/compile/
Как это сделать и где это есть?

заходим через фТП в папку /tools/smarty/compile/ и удаляем все что там есть