А подключить все ИМ к одной общей БД почему нельзя?

Чтобы не потерять тиц пусть используют nofolow и noindex.

Во-первых обычно база доступна для доступа только с локалхоста, и если даже удасться подключится, то обмен данными будет происходить долго. клиент устанет ждать загрузки страницы.

"в лоб" такую штуку мало кто умеет делать. могут, например, магенто и вейтон.
криво это можно реализовать на osc.
как вариант, можно установть что-то типа ордер мастера, и направлять оплату со всех сайтов на него после оформления заказа для оплаты товара (не обязательно из магазина, можно и из блога, и из новостей, и даже с гс).
либо еще можно воспользоватьтся saap системами с таким функционалом - западным 2checkout и нашим элкоммтулзом.

в случае конкретно престы можно установить версии магазинов на разных доменах с обращением всех к одной базе данных. при этом дизайн либо будет один у всех, либо у каждого на сайте в папку с конкретным дизайном класть разные дизайны.
но все описания-цены при этом останутся едиными (в случае с магенто и вейтон они могут быть разные на разных сайтах, в случае виарта - едины).

Создайте у своего партнера субдомен второго уровня, привяжите к нему ваш интернет-магазин и ссылка на странице партнера пусть ведет на этот субдомен - клиенты будут думать, что они остались на том же сайте, просто погрузились на другой его уровень.

Как скопировать БД клиентов ?

Почему нельзя? Можно написать скрипт который будет с вашей базы выводить товары.

ors нужно сделать так что бы сначала полностью грузилась страница, а после ее загрузки в конце начинается коннект к внешней базе. тем более постоянного коннекта при обновлении страницы не будет, ибо я бы вобще сделал по крону работу скрипта, который записывает данные в html файл а этот файл уже выводится в нужном месте. у меня так все работает и безопасно и быстро.