Может быть есть какой то нулленый модуль, бюджетный, посоветуйте. В магазине очень много позиций, хочу сделать скидки на определенные категории.

Понятие много относительное. Если будете менять цены по тысячам позиций, то с модулями могут быть проблемы, потому что такое обновление будет требовать много времени, а хостпровайдеры сбрасывают выполнение скриптов по времени. Попробуйте реализовать снижение цен через ценовые правила.

Добрый день. Как так-то? Неужели нет автоматического какого-либо массово способа? Через ценовые правила не получится. так как товары, для которых скидка одновременная назначается, находятся в разных разделах.
Просто менять 10 000 без автоматического способа - это жуть.