Импортировать комбинации можно в ПУ > Конфигурация > Импорт CSV :: в списке выбрать импорт комбинаций.
Пример для одной комбинации:
S-M-L белый
Код:
№ товара;Атрибут (Название:Тип)*;Значения (Значение)*;Влияние на цену;Кол-во
1;Цвет:color,Размер:select;белый,S;0;10
1;Цвет:color,Размер:select;белый,M;0;10
1;Цвет:color,Размер:select;белый,L;0;10
В примере 1 это ID товара - заменить на необходимый