Подскажите после добавления второго товара в корзину предыдущий пропадает и если нажать оформить заказ пишет ваша корзина пуста. Что это может быть?

В этой цепочке мест для ошибок море. По такому описанию понять ни чего не возможно. Ищите ошибки в логах или в JS-консоли браузера.