При добавлении товара в корзину (Уже зарегестрированным пользователем) и последующем оформлении пишет: нет доступных методов оплаты, подключен модуль "оплата наличными", при перезагрузке страницы все появляется - куда копать? Заметил что при отключении Аякс-корзины такого не наблюдается

Без ссылки в интернет-магазин найти ошибку сложно!
Приложите ссылку или снимки экрана с ошибкой (при тестировании запустите консоль, проверьте наличие ошибок при загрузке данных).